肯定要處理，一般納稅人注銷時庫存很大，稅務機關要求進項轉出，否則注銷了，將來處理就自然涉及到繳稅。所以注銷前庫存必須清理，進行納稅清算，最后才能注銷稅務登記。

對已認定為一般納稅人的新辦商貿零售企業，但未從事貨物零售業務的，應取消其一般納稅人資格。一般納稅人注銷或被取消輔導期一般納稅人資格，轉為小規模納稅人時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予退稅。